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北、长江流域以至东南沿海地区的武装起义，是以明教、弥勒教、白莲教等宗教组织揉合起来发动的，</br></br>当时、北方以广平府永年县白鹿庄庄主韩山童为主，南方以袁州南泉山慈化寺主持彭莹玉为代表，他们竭力鼓动信众，倡言天下即将大乱，因为“明王出世”、“弥勒降生”，为了拯救世人于水火之中，要民众起义抗元。</br></br>至正十一年xM</br></br>五月，明王韩山童在颖州与日宗宗主刘福通聚徒众三千，歃血为盟、高举义旗，发出讨元檄文，准备起兵，不料事泄、韩山童遭擒被杀，其妻杨氏和子韩林儿走避武安山中，当时，追随他们身边的便是圣门徒众。</br></br>当时刘福通等率五旗令主及麾下徒众，苦战元军，杀出重围，并且出其不意的攻占了颖州，于是贫苦的民众以及当时被逼着修河的民夫，也纷纷杂官起义，前来会合，于是圣门声势大振。</br></br>到了九月，圣门大军攻下信阳、汝宁、光州、息州等地，队伍扩充至十万余人，由于这批人马由五旗令主中的火令令主作为主力，所以最初的徒众是头扎红帕，身穿红衣，打着红旗，所以被称为“红巾”或“红军。”</br></br>至正十二年二月，郭子兴、孙德崖等人起兵于濠州，也是仿照红巾军的装东，不过这批人供奉弥勒佛，每夜烧香拜佛，故又被人称之为“香军”，当时，这批起义军队，活跃于江淮之间，黄河两岸，而郭子兴其实亦是月宗子弟，属于月宗一脉，后被升为月宗宗主。</br></br>在大元至正十一年八月时，星宗宗主，彭莹玉和徐寿辉、邹普胜、倪文俊等于黄州，蕲州起义，亦称红巾军，并且建立政权，以徐寿辉为皇帝，国号“宗。”</br></br>不过到了至正十三年春天，彭莹玉率部和元军激战，结果大败，退入江西饶州及瑞州。</br></br>十一月，彭莹玉战死，被俘之将相兵士四百余人，徐寿辉率残兵败率退入沔阳湖中，其中也有一批人藏匿于黄梅山里，准备东山再起。</br></br>大元至正十五年二月，刘福通等圣门徒众，迎立韩林儿为帝，称为小明王，确立其明王之位，国号宋，建都于毫州，建元龙凤。</br></br>此后三年里，红巾军兵分三路，大举进攻，东路由水旗令主毛贵率领大军，连破山东廖州，莱州，莒州、滨州等地。</br></br>中路由上旗及金旗令主率军，首先进击大名府，之后越过太行山，进入山西，攻下潞州、高平、除州等地。</br></br>至于西路军则由木旗令主李仲贤率大将白不信进窥关中，攻秦陇一带，不过在进入凤翔时陷入重围，溃败之后，李仲贤聚集旧部，进入蜀境，据成都一地，改扎青巾、自号“青巾军。”</br></br>龙凤四年二月，水旗令主毛贵所率之东路军，攻克济南府，大败元军，乘胜挥兵北上，直抵天津，直逼元朝大都北京。</br></br>而中路军也发动攻击，直取山西、河北，攻下了元朝的上都。xM</br></br>五月间，刘福通率火旗令徒众，统领大军，攻下了汴梁，于是迎来小明王韩林儿，以汴梁为都城。</br></br>至此时，中原地区，差不多有三分之二为红巾军所控制，也是圣门势力最盛的时期。</br></br>不过，在这段时期里，各地的豪强地主，也趁着元朝的统治势力极度削弱之际，扩展各自的势力范围，割据一方，纷纷成立所谓的义军、乡军、民军。</br></br>此后数年中，各地的义军和乡军，为了争夺地盘而争战不休，而红巾军中则是龙蛇混杂，稍具规模之后，便发生内斗，争权夺利之际，圣门开始分裂。</br></br>睚十九年八月，最强大的一股元兵部队，由察罕帖木儿统领，在河南、山东连败红巾军，并且攻破龙凤政权的都城汴梁。日宗宗主刘福通于城破前，挟小明王突围，退至安丰一带。</br></br>棒年，南方徐寿辉的红巾军发生内讧，倪文俊和徐寿辉不和，率部从汉阳至黄州，结果被部将陈友谅所杀，陈友谅自称汉王，后来杀徐寿辉，在采石王通庙即帝位，国号大汉，改元大义。</br></br>由于陈友谅称雄于湖广、江西一