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日本舰队残余官兵，全部上岸投降，接受明军安置，其残余的舰队约二十艘，被明军官兵完全掌握。于是，全部行驶进旅顺军港内停泊。
毛仲在岸边，见到了奄奄一息的日本天皇和德川大将军，“你是天皇？”
“嗯！”日本天皇点头，衰弱到了极点的他只能轻轻蠕动示意。
从服装和依仗上看，这些人确实是日本的最高标准，毛仲从几个旅顺渔民口中，以其传闻来证实。于是，安置了日本人，将天皇和德川将军弄进旅顺城中，又答应了日本医生给药物的要求，其余日本人，临时在港内搭建了一些棚屋住了。
日本人捧着明朝百姓给的大`饼，一个个惊喜异常，又是蹦又是跳，有的还朝百姓鞠躬跪拜，有的抓住饼子，生吞活剥，囫囵吞枣，样子极其不堪。在争夺稀饭的时候，渴望了已久的日本人，居然打了起来。
总共上岸的日本人有两千一百多人，而据三浦优秀说，从日本国内逃出时，他们有六千多人，全部是贵族和军队，以及家属。
毛仲的身边，有了三浦和石原两个常驻的日本代表，他们之间的对话也逐渐多了起来，毛仲主要是了解日本的国内情况，通过许多细节，毛仲觉得，这些人绝对是日本贵族，可是又奇怪，那些能够颠覆一个国家的敌人，究竟是什么人，能够制作蒸汽轮船，能够制作近代的爆炸式炮弹，那么先进的武器，比自己只强不差。
毛仲并无援助日本的意向，主要注意力在于，一来，防范上岸的日本人吃饱了撑的闹事儿，二来，关注着海洋上那支强大而诡诈的舰队，三来，急切地等待着辽东军各将领的消息。还有一层，是倾听京城的动向，他在京城闯下了那么大的祸害，真不知道如何了结。
十余天时间，旅顺发生了惊天动地的变化，先是各路部队纷纷赶回了旅顺，最主要的是三支，陈老将和陈继勋哥儿俩的五千部队，陈为国和蓝序的三千骑兵，沈世魁的六千步骑兵，纷纷拥到了城内外驻扎，接着，京城有人来，不过一介使者，调查辽东军副总兵朱国栋是否派遣人员往京城公干。毛仲将京城的事情给诸位将领讲了，陈老将等人听了，大为震惊，随便打发了朝廷的使者，就商量下一步的打算。毛仲又引几位将领会见了日本人，讲述了日本国内的巨大变化。
“这不结了？”陈继盛在愁苦之际，忽然大喜：“我等可以引兵东去，名义上去救助日本，为大明开拓疆域，其实，避祸东洋，名正言顺。”
这是大家都能认可的办法，招惹了朝庭和皇帝的举动，是无法被原谅的，同时，大家对于温体仁和皇帝内外勾结，掠夺良家女子的做法，极为反感，认为这是昏君之举，祸国殃民。虽然有些人认为毛仲过激，可是，陈老将极为重视外甥闺女冰梅，既然毛仲是为救她而出手，做什么也不算过火。“这样无道的昏君，就是杀了也不觉得可惜！”
诸位将领也为他们的努力不值，这边，战场上拼命，那里，你皇帝和大臣却整天花天酒地，一门心思想着人家的闺女，甚至不惜卑鄙手段，更多的人义愤填膺，要求将部队集结起来，向京城进军。讨伐昏君。
蓝序就说：“以我目前辽东军势力，举大明朝廷相抗衡，都不是对手，”
不过，也有不同意见，沈世魁道：“以下犯上，非议朝廷，毕竟是叛乱之道，我绝对不作如此罪恶之谋！”
最终，权衡利弊，陈老将还是征询了毛仲的意见，然后决定：“我等离开旅顺，东征日本！”
因为担心朝廷的军队大举进攻，特别是担心辽东军内部的分裂，以沈世魁为首的原皮岛军的异己，陈老将决定立即动身，将愿意东去的将士，连同家属，全部装运上船，而留下沈世魁为旅顺和辽东守将。“此后辽东事宜，全凭沈兄作主。”沈世魁见陈继盛这样安排，也非常感动，遂将所有物资，任凭陈老将截取。
辽东军六千，外加家属一万余人，分乘二百余号大小船只，组成左右两路舰队，将旅顺港内的军工企业，悉数移走，然后，汇合了日本舰队，浩浩荡荡，向着东方而去。
路上，日本舰队打出旗帜，派遣人员过来报丧，日本德川将军因为伤重，已经死了。
舰队东北而上，到了海洋岛，派遣人手，去通知长山，石城诸地守军，到海洋岛汇合，征集东征的部队物资。各岛听说智主力东返，纷纷赶到海洋岛，一时间，海洋岛上，舰队云集，官兵如潮，各岛赶来的三千守军加上近万家属，进一步壮大了部队实力。
在海洋岛上，按照日本德川将军的遗愿，将之火化，三日后，在大军出征前，日本天皇病故。
日本人举国而恸，最终，由大皇子就位新天皇，而德川将军家，也选举出了一子为幕府将军。
乱纷纷之中，明军之中，也发生了几件大事情，一是几名军官叛逃，率领三艘舰船向西去了，一是瘟疫传播，许多官兵得了疾病