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这些潜艇吨位大，续航能力强，能长时间呆在水下，适用于远洋作战和运输使用。
日本人的潜艇很少成群集队的活动，一般是单艇出击，其单艇作战能力较强，这就是有名的“伊”字号潜艇。一艘这种潜艇甚至击沉过“约克城号”航空母舰。虽说“约克城号”当时是在日机空袭中受了伤，但如果没有日本潜艇那最后致命的一击，这艘航空母舰是决不会在中途岛一役沉入太平洋的滚滚浪涛中。
拟议中，日本人曾计划建造潜水航空母舰，设想中的大型潜艇将在封闭式甲板上载着飞机在水下潜行，到达指定点后，潜艇上浮，甲板的封闭外壳打开，飞机从甲板上起飞去突袭敌人。日本人计划用这种方法对美国西海岸的城市如旧金山等动空袭。但由于这种潜艇航母造价过于昂贵，同时也还存在诸多技术问题不是短时间内可以解决的，因此这个计划只是停留在纸上的一种设想，并没有付诸实施。而微型潜艇则是日本人认为的利器，也用于了实战。这6次袭击是；1941年12月8日的珍珠港事变，但并未取得任何战果，有6艘微型潜艇参战，2艘被美军现并被击沉，一艘搁浅，艇长酒卷少尉被美军俘获。其余3艘无功而返。其它的5次袭击是1942年5月31日对澳大利亚悉尼港口的袭击，1942年11月23日和12月7日，两次参与了瓜达卡拉尔岛的争夺战，企图袭击美军运输舰队未果。1942年5月31日在马达加斯加海面，打算攻击一艘美军油船，结果被护航的驱逐舰现，4艘微型潜艇未能斗过两艘美军驱逐舰，全部饮恨长眠于太平洋海底。1945年1月5日菲律宾战役中在棉兰老岛以西，2艘微型潜艇被一架美军水上飞机追得慌不择路，一艘当场触礁沉没，另一艘潜入了大海深处就再也没能浮起来。在这些袭击**有14艘微型潜艇被击沉，27名艇员死亡，1人被俘，但取得的战果却微乎其微。
与微型潜艇同时生产的，也是双人座的另一种小潜艇叫“海龙”，航程25o海里，可携带两枚鱼雷攻击机上使用的那种机用鱼雷。日本人将它作为最秘密的武器储藏起来，准备在本土决战时用它重创美军舰队。到战争结束时共生产了23o艘，但一艘也没有投入过战斗。
另一个引人注目的失败的东西是名叫“回天”的特攻武器。实际上这是一种“人肉鱼雷”，说穿了就是在一颗鱼雷上安装两把钢制简易座椅，座椅前面有一小块挡风玻璃，鱼雷尾部再装上一个小动机。乘员两名。一人控制方向，一人确定目标。鱼雷高撞向目标，连人带鱼雷一齐爆炸，从而达到摧毁敌方军舰的目的。这种特攻武器往往是由一艘潜艇将其带到目标附近，然后射出去的。一开始这些“人肉鱼雷”还真的取得了一些战果。一艘这样的鱼雷潜入乌利堤环礁湖击沉了一艘载有5o万加仑航空燃油的美军油船“密西西尼亚号”，这次成功使日本人大受鼓午，并针对它的缺点进行了改进。最后定型生产的“回天”，长54英尺，弹头装有3ooo磅高爆炸药。日本人称这种特攻武器能击沉任何水面舰船。
一艘“伊”字号大型潜艇可带4枚“回天”，并能神不知鬼不觉的潜到美军舰队集结地，一举击沉4艘美**舰。但这只是日本人一厢情愿的想法和期望而己。的确，在开始时美国水兵们也为这些小东西而头痛过，雷达根本现不了它，声纳对它也没用，而空中巡逻的美机要现“回天”那在波峰浪谷中隐蔽窜行的踪影很是困唯。但美国人不是傻蛋，他们很快就现了度比“回天”更快的鱼雷快艇来对付这种人肉鱼雷是一仵很容易的事情。鱼雷快艇不仅能用度上的优势来拦截住“回天”，而且艇上的4o毫米连机关炮绝对不是骑在鱼雷背上没有丝毫防护的日本特攻敢死队员所抵抗得了的，往往会将这些日本兵打得粉碎甚至连带上他们的鱼雷坐骑也会被轰然打爆。日本人曾对盟军射过数以千计的“回天”鱼雷，取得的战果是:击沉一艘加拿大的货船‘加拿大胜利号‘，击沉过一艘美军的护卫驱逐舰“恩德希尔号”。但在这一系列的特攻中，却有9oo余名日军死于“回天”攻击中，仅此而己。
被寄以厚望的“飞象行动”是一个雄心勃勃地庞大计划。并付诸了行动。这个行动的主要内容就是用高空大气球对美国西海岸和加拿大进行袭击，这就是一度使美国人极为震惊的“汽球炸弹”。这是一种直径大至1o米的氢气球，是被误认为是搞原子核研究的日本登户研究所的成果。最初研制这种气球的目的是驻中国东北的关东军使用它向黑龙江对岸的苏联军队散传单和轰炸用的。一开始，日本军方对这种“汽球炸弹”评价并不高。但从当时担任美国西部防卫司令部参谋长的.h.威尔巴特准将在战后表的《日本人的汽球炸弹》一书来看，美国人对这种汽球炸弹的顾忌出了日本人的估计。威尔巴特将军写道：
“尽管这种汽球连无线电装置也没有，非常原始，无法进行