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《革弊诏》一经颁布，果然是引起了轩然大波，有支持赞同的，也有皱眉反对的，各地总督、总兵、巡抚、知府也纷纷递折子，也是对《革弊诏》毁誉参半，崇祯也担心会引起朝廷的分裂，便只好召来朱舜水等人商议。
崇祯便问：如今群臣议论纷纷，虽然朕一力下发，也无不可，但是具体到执行上还是需要各地大员配合，朕也总不能把反对的挨个杀了，换上新的吧，诸位爱卿有何意见？
朱舜水便道：陛下，如今的情形，多是诸位同僚不知陛下忧虑所致，臣以为当召集各地督抚至京城，并令凡五品以上官员参与大朝会，详加解释，令群臣知道陛下的良苦用心，倘若如此，还有不知进退者，再行处置不迟。
崇祯想了多时道：罢罢罢，看来眼下只能如此，那便依爱卿所奏，即刻下诏，令各地总督、总兵、知府、巡抚、知州即刻抵京，并令京畿五品以上官员参与大朝会。
由于铁轨马车的修筑，各地官员来京速度大大加快了，即便如此，各地官员还是用了一个多月的时间才到，崇祯便将大朝会的时间定在了十月十六日。
到了十月十日，崇祯先行在中和殿召见了丁启睿（陕甘宁三边总督）、熊文灿（福建总督）、王尊德（两广总督）、洪承畴（辽东总督、朝鲜总督）、刘含辉（顺天府知府）、王绍徽（济南府知府）、翟凤翀（天津港府知府）、方岳贡（松江港府知府）、吴伟业（福州港府知府）、黄景昉（广州港府知府）、周钟（福建戍卫军总兵、台湾巡检戍卫军总兵）、胡一青（察哈尔招抚使司戍卫军总兵）、惟贤（顺天府戍卫军总兵）、范文淑（济南府戍卫军总兵）、原毓宗（应天府戍卫军总兵）、秦世英（贵阳府戍卫军总兵）、袁弘勋（山东戍卫军总兵）、袁兆基（北直隶戍卫军总兵）、杨御蕃（胶州港府戍卫军总兵）、丘瑜（陕甘宁三边戍卫军总兵）、张焘（胶州港府戍卫军总兵）、潘世奇（福州港府戍卫军总兵）、任明道（广州港府戍卫军总兵）等人，朱舜水等人也参加了召见，行过礼后，崇祯便道：诸位爱卿在地方上为国尽忠，颇为辛苦。丁启睿便出列道：臣等何敢言苦。崇祯便道：诸位爱卿要么是三朝老臣，要么是随朕征战之臣，要么是朕身边出去的，可以说是朕的股肱，此番召集大朝会，为的就是听听诸位对《革弊诏》的看法，今日有什么想说的不妨直言不讳，莫待他日，令你我君臣离心。
刘含辉便出列道：陛下，臣以为陛下用心良苦，《革弊诏》所实行之策，俱是国家大计，比如此次，陛下将诏狱移至内监司，又在内监司增设宗人所，诏狱从此不再是某些人专断的刑狱之所，而是成为约束宗亲之处，陛下意欲行法治，首先从宗亲做起，令臣甚为感动，所谓上行下效，天下大治不久矣。众人纷纷应和，洪承畴也出列道：刘大人所言甚是，自此天下刑狱尽归刑部，法自所出，俱有典章法曹，令人信服，此外，陛下将各地锦衣卫由千户升格为镇抚使，亦颇有道理，臣别的不知，单说辽东和朝鲜，现在虽然与鞑子陷入僵持，但是暗中不知派了多少探子过来，多亏锦衣卫辽东千户所和朝鲜千户所支持，才破获了多起破坏事件，但是千户所人员少、级别又不高，锦衣卫们待遇也是不甚高，臣本想为他们上表，又恐陛下不快，此番陛下此番调整，臣举双手赞同啊。
熊文灿也道：臣久在海疆，自开海禁以来，贸易收入几占国库收入三分之一，陛下又御驾亲征，击败荷兰人，平定东南，才有这四海服宴，只是对于内外廷，朝野内外多有非议，只恐内廷滥用法令，先帝朝之事重现，臣也令人在书院辩论，也是各有理论，终不得其法。
崇祯才道：正因为天下人有误解，朕才召集此次大朝会，为的就是向天下人一一解释，平抑天下非议。朱舜水便接过话来说：各位大人久在地方，不知陛下的难处，自三大案后，渐有一股暗流，妄图螳臂当车，阻挠陛下诏令下达执行，陛下唯恐深究之对朝廷不利，风评亦且不妙，故不得已增设内廷，将内阁审批和执行之职加以分开而已，翰林院和内阁一个负责审批，一个负责执行，彼此牵制，而在内廷之中，翰林院亦不是一家独大，通政使司掌印玺，笔录编译司掌存档，又令御史台有纠核之权，如此一来，不让权力集中在一处，彼此监督，这才是陛下设内廷之初衷。
熊文灿忙跪下道：此种种事，臣竟不知，臣有罪。崇祯便忙道：熊爱卿快快平身，爱卿招降郑芝龙，平定东南，屡立大功，何罪之有。熊文灿这才谢了恩，崇祯又对众臣多加勉励一番，这才令众臣跪了安。
十月十三日，崇祯又集中召见了野战军诸位总兵，因着许定国和卢象升在辽东前线，所以二人并未来京，只是派了左同知前来，崇祯不免又述说一番，曹文诏只是道：陛下，臣等皆是武将，过去武将地位和待遇一直在文臣之下，陛下此次革新，提高武将地位和待遇，臣等皆欢欣鼓舞，官兵